9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0696 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0696  rubrerythrin  100 
 
 		 157 aa  320  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.240604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0707  rubrerythrin  95.54 
 
 		 157 aa  306  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2573e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  34.21 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2774  rubrerythrin  33.59 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  32.31 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2081  hypothetical protein  28.46 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1466  rubrerythrin  30.53 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.592561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0435  hypothetical protein  26 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000392041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0625  hypothetical protein  22.86 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.45184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>