8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0435 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0435  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  317  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000392041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2081  hypothetical protein  31.13 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2774  rubrerythrin  30.82 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  27.33 
 
 
345 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1466  rubrerythrin  29.05 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.592561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  28.67 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0707  rubrerythrin  26.67 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2573e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0696  rubrerythrin  26 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.240604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>