13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3003 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3003  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0579  hypothetical protein  45.7 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0591211  normal  0.536359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0625  hypothetical protein  44.08 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.45184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1859  hypothetical protein  45.95 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000532381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0597  hypothetical protein  43.15 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1786  hypothetical protein  45.95 
 
 		 154 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0724  hypothetical protein  41.56 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1593  hypothetical protein  40.67 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  31.33 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2081  hypothetical protein  27.45 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2774  rubrerythrin  28.26 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  27.97 
 
 		 345 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1466  rubrerythrin  26.81 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.592561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>