23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0861 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  76.61 
 
 		 215 aa  270  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  68.42 
 
 		 215 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  44.72 
 
 		 224 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  44.96 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  43.31 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  44 
 
 		 221 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  44.04 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  36.88 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  37.86 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  46.67 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  36.88 
 
 		 204 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  32.3 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  46.38 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  38.67 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  58.7 
 
 		 495 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  58.7 
 
 		 495 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  58.7 
 
 		 503 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4632  methylenetetrahydrofolate reductase  56.52 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>