24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0461 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  44.7 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  43.32 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  45.89 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  44.04 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  39.91 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  37.32 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  37.81 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  32.26 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  34.93 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  44.04 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  31.5 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  28.16 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  40.91 
 
 		 538 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  38.75 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0302  hypothetical protein  28.77 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  31.31 
 
 		 523 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  54.76 
 
 		 495 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  54.76 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  54.76 
 
 		 503 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4632  methylenetetrahydrofolate reductase  52.38 
 
 		 495 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>