22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1152 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  51.38 
 
 
222 aa  248  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  52.49 
 
 
224 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  50.68 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  41.78 
 
 
223 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  42.86 
 
 
226 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  43.46 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  43.64 
 
 
221 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  39.41 
 
 
204 aa  136  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  34.7 
 
 
215 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  34.27 
 
 
215 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  30.1 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  28.78 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  46.43 
 
 
538 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  40.51 
 
 
195 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  27.78 
 
 
523 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  47.83 
 
 
495 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  47.83 
 
 
495 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  47.83 
 
 
503 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>