16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1007 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  29.91 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  27.62 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  27.14 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  28.78 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  29.3 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  26.67 
 
 
204 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  26.24 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  28.16 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  25.69 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  28.95 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  25.93 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  24.55 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  32.84 
 
 
171 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0915  hypothetical protein  23.76 
 
 
155 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>