22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1635 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  34.31 
 
 
215 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  31.86 
 
 
215 aa  94.4  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  30.89 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  32.3 
 
 
171 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  31.5 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  28.98 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  28.72 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  29.1 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  30.92 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  31.22 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  30.29 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  30.1 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  33.87 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  38.27 
 
 
523 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  50 
 
 
538 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  34.52 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  31.88 
 
 
503 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  31.88 
 
 
495 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  31.88 
 
 
495 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4632  methylenetetrahydrofolate reductase  31.88 
 
 
495 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>