13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2676 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2676  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  857    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000629143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2342  hypothetical protein  52.86 
 
 
420 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0336919  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1807  hypothetical protein  34.53 
 
 
415 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2672  hypothetical protein  33.72 
 
 
400 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000390899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1539  hypothetical protein  33.49 
 
 
400 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1543  hypothetical protein  33.49 
 
 
406 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0990  hypothetical protein  32.2 
 
 
414 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2152  hypothetical protein  32.63 
 
 
431 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2035  hypothetical protein  29.49 
 
 
332 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  28.17 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  34.29 
 
 
353 aa  46.6  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  32.91 
 
 
227 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  36.07 
 
 
212 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>