12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4814 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4814  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2990  hypothetical protein  56.61 
 
 
219 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2816  hypothetical protein  57.4 
 
 
276 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2438  putative non-heme haloperoxidase  54.71 
 
 
197 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34557  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2021  hypothetical protein  28.95 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182904  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2772  hypothetical protein  45.05 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4308  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
320 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
294 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
302 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
302 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
302 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>