19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2021 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2021  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  540  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182904  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4308  hypothetical protein  47.15 
 
 
253 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2772  hypothetical protein  44.26 
 
 
246 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4814  hypothetical protein  29.05 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2816  hypothetical protein  32.6 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2990  hypothetical protein  27.91 
 
 
219 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  27.41 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.35 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.35 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  31.45 
 
 
540 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  28.02 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>