71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4151 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4151  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  227  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  36.46 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  36.25 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  35.78 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  37.84 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  34.21 
 
 
375 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  39.74 
 
 
191 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  36.27 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  34.74 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  37.33 
 
 
174 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  37.33 
 
 
174 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  34.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  34.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  33.33 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  34.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  34.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  33.75 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  29.79 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  35.42 
 
 
242 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  36.23 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  32 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  41.27 
 
 
166 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  42.31 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  31 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0576  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  42.47 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  30.26 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  30.26 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  34.18 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  31.65 
 
 
183 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  32.89 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  37.11 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  33.71 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  48.94 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  33.78 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  48.94 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  30.86 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  30.21 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  27.37 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  30.86 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  28.4 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  28.4 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  31.18 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  36.92 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  28.4 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  30.86 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  41.27 
 
 
166 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  38 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  32.1 
 
 
170 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  34.92 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  33.68 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  30.53 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  28.95 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  28.95 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  28.95 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  45.65 
 
 
347 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  28.95 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  37.68 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  25.35 
 
 
171 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>