13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2742 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1691  hypothetical protein  78.08 
 
 		 719 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000698104  normal  0.329824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2546  hypothetical protein  75.67 
 
 		 723 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0691486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2742  hypothetical protein  100 
 
 		 716 aa  1367    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00817564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4083  hypothetical protein  41.2 
 
 		 685 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392788  normal  0.0298659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8577  hypothetical protein  34.68 
 
 		 481 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431324  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6847  hypothetical protein  35.79 
 
 		 580 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000672323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6726  hypothetical protein  32.78 
 
 		 411 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  40.37 
 
 		 2179 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  37.37 
 
 		 2272 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2449 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  35.51 
 
 		 3322 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.58 
 
 		 2313 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  35.87 
 
 		 3692 aa  47.4  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>