More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1475 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4990  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.85 
 
 
963 aa  1164    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1475  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
1101 aa  2110    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0542  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.06 
 
 
932 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2304  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.66 
 
 
890 aa  347  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64465  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.49 
 
 
890 aa  345  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36790  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  32.57 
 
 
919 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0946  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.23 
 
 
895 aa  342  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245862  normal  0.321731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0997  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.16 
 
 
895 aa  338  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2130  cell division FtsK/SpoIIIE  36.15 
 
 
850 aa  326  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282624  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0157  cell division FtsK/SpoIIIE  31.13 
 
 
800 aa  300  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1599  cell division FtsK/SpoIIIE  35.07 
 
 
886 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5950  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.49 
 
 
1124 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3333  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.62 
 
 
822 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4741  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.61 
 
 
879 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.62 
 
 
894 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4305  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.76 
 
 
850 aa  165  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.356643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.25 
 
 
1020 aa  111  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.33 
 
 
1604 aa  98.2  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  29.34 
 
 
1528 aa  97.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.59 
 
 
1446 aa  95.9  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.61 
 
 
1502 aa  94.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
1447 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.22959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  33.66 
 
 
1493 aa  94  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.7 
 
 
1346 aa  94  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.91 
 
 
895 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.672638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  30.53 
 
 
1456 aa  90.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07490  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  35.32 
 
 
999 aa  90.1  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.57 
 
 
1579 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  30.29 
 
 
1363 aa  89.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  31.78 
 
 
1468 aa  89.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  30.92 
 
 
1141 aa  88.6  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.542056  normal  0.588132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  32.18 
 
 
1481 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.51 
 
 
1478 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.29 
 
 
2947 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0805  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.55 
 
 
1467 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890485  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.69 
 
 
1438 aa  85.9  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.29 
 
 
1463 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  30.62 
 
 
1488 aa  85.1  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2826  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.13 
 
 
1065 aa  84.7  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  30.98 
 
 
1346 aa  84.7  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4810  cell division FtsK/SpoIIIE  33.33 
 
 
1316 aa  84.7  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  33.48 
 
 
1477 aa  84.7  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.65 
 
 
1349 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0407  cell division FtsK/SpoIIIE  32.59 
 
 
1316 aa  84  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  37.2 
 
 
1399 aa  83.2  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.67 
 
 
1249 aa  82.4  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  31.73 
 
 
1488 aa  81.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  32.6 
 
 
608 aa  81.3  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0693  cell division FtsK/SpoIIIE  27.72 
 
 
1615 aa  81.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33.17 
 
 
1360 aa  81.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0303  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.66 
 
 
1326 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3495  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.3 
 
 
1555 aa  79.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733864  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  29.91 
 
 
1484 aa  78.2  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.5 
 
 
1315 aa  78.2  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.06 
 
 
1318 aa  78.2  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  32.61 
 
 
1327 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.01 
 
 
1229 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.01 
 
 
1229 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.01 
 
 
1229 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0991  cell division FtsK/SpoIIIE  30.26 
 
 
1340 aa  75.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.08 
 
 
1278 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  29.07 
 
 
1335 aa  73.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11814  hypothetical protein  31.61 
 
 
1391 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284555  normal  0.623298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.43 
 
 
1336 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  29.93 
 
 
1236 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.51 
 
 
1312 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.29 
 
 
1320 aa  73.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786976  decreased coverage  0.000163862 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1871  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.24 
 
 
655 aa  73.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5461  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.03 
 
 
1380 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4137  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.17 
 
 
849 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  30.69 
 
 
1303 aa  72.4  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1210  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.53 
 
 
1320 aa  72  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.978992  normal  0.356707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.17 
 
 
745 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.17 
 
 
884 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.34 
 
 
1348 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0075  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.17 
 
 
745 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0751405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.17 
 
 
745 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.627521  hitchhiker  0.00968716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1683  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.13 
 
 
1359 aa  72  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2491  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.31 
 
 
1313 aa  72  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717331  normal  0.28838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.88 
 
 
1333 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0694  cell division FtsK/SpoIIIE  30.93 
 
 
1336 aa  71.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.809205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  30 
 
 
928 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0607  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.44 
 
 
1315 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  29.17 
 
 
837 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.75 
 
 
850 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0074  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.69 
 
 
740 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.669354  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  29.57 
 
 
1091 aa  70.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.75 
 
 
932 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.75 
 
 
841 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0771  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.69 
 
 
742 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.89 
 
 
648 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3214  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.33 
 
 
1330 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.248908 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0389  DNA translocase FtsK  29.22 
 
 
1068 aa  68.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0445802  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4625  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.43 
 
 
1332 aa  68.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18785  normal  0.38778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0793  ATPase  32.17 
 
 
833 aa  68.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.948463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  28.63 
 
 
1014 aa  68.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  25.29 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  29.15 
 
 
1369 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.55 
 
 
1310 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  29.15 
 
 
1342 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>