More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0542 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0542  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
932 aa  1857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36790  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  51.89 
 
 
919 aa  848    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.64 
 
 
890 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1599  cell division FtsK/SpoIIIE  45.96 
 
 
886 aa  625  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2304  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.53 
 
 
890 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64465  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4990  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.5 
 
 
963 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1475  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.81 
 
 
1101 aa  355  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0997  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.25 
 
 
895 aa  350  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0946  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.19 
 
 
895 aa  350  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245862  normal  0.321731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2130  cell division FtsK/SpoIIIE  34.32 
 
 
850 aa  334  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282624  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0157  cell division FtsK/SpoIIIE  32.67 
 
 
800 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4741  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.62 
 
 
879 aa  240  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4305  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.49 
 
 
850 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.356643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5950  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.78 
 
 
1124 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.52 
 
 
894 aa  157  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3333  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.9 
 
 
822 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.48 
 
 
1020 aa  124  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.78 
 
 
1502 aa  97.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.48 
 
 
1604 aa  94  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.65 
 
 
1438 aa  92.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.5 
 
 
895 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.672638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.48 
 
 
1446 aa  90.5  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  34.25 
 
 
1488 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  34.16 
 
 
1468 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.49 
 
 
1346 aa  90.1  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  33.05 
 
 
1528 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0805  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.68 
 
 
1467 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890485  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.62 
 
 
1478 aa  88.2  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  33.17 
 
 
1493 aa  87.8  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  33.49 
 
 
1447 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.22959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  32.2 
 
 
1481 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3495  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.24 
 
 
1555 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.08 
 
 
1348 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  31.34 
 
 
1488 aa  84  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33.5 
 
 
1360 aa  83.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.43 
 
 
1303 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.41 
 
 
1463 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2826  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.95 
 
 
1065 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  31.1 
 
 
1456 aa  82  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0074  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.39 
 
 
740 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.669354  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  30.65 
 
 
608 aa  80.5  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0693  cell division FtsK/SpoIIIE  31.56 
 
 
1615 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  31.34 
 
 
1484 aa  79  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31 
 
 
1312 aa  78.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.95 
 
 
745 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0075  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.95 
 
 
745 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0751405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.95 
 
 
745 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.627521  hitchhiker  0.00968716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  30.85 
 
 
1363 aa  77.8  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  32.7 
 
 
1477 aa  77.8  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0771  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.95 
 
 
742 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  27.44 
 
 
607 aa  77.4  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07490  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  32.81 
 
 
999 aa  77.4  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.46 
 
 
1141 aa  76.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.542056  normal  0.588132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4625  cell division protein FtsK/SpoIIIE  32.04 
 
 
1332 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18785  normal  0.38778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  31.6 
 
 
1399 aa  75.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.97 
 
 
2947 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.58 
 
 
1579 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.39 
 
 
1249 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4810  cell division FtsK/SpoIIIE  32.16 
 
 
1316 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0865  cell division FtsK/SpoIIIE  30.48 
 
 
1335 aa  75.5  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.351933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.05 
 
 
1229 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2491  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.33 
 
 
1313 aa  74.7  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717331  normal  0.28838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.05 
 
 
1229 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.05 
 
 
1229 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13905  transmembrane protein  28.51 
 
 
747 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.22 
 
 
1336 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5557  cell division FtsK/SpoIIIE  29.8 
 
 
1389 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.8 
 
 
1389 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2209  FtsK/SpoIIIE family protein  28.77 
 
 
1335 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.32787e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2035  FtsK/SpoIIIE family protein  28.77 
 
 
1342 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1917  FtsK/SpoIIIE family protein  29.25 
 
 
1503 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.054291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0278  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.84 
 
 
1479 aa  72.8  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.50338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.76 
 
 
1349 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2190  FtsK/SpoIIIE family protein  28.77 
 
 
1342 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3214  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.39 
 
 
1330 aa  72.8  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.248908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3216  ftsk/spoiiie family protein  29.25 
 
 
1501 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.616613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.99 
 
 
1320 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786976  decreased coverage  0.000163862 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0271  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.84 
 
 
1479 aa  72.8  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1985  FtsK/SpoIIIE family protein  28.77 
 
 
1342 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.93 
 
 
1315 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2089  ftsk/spoiiie family protein  29.25 
 
 
1503 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2025  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.77 
 
 
1336 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.436887  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.92 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.93 
 
 
1333 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1301  FtsK/SpoIIIE family protein  29.74 
 
 
1169 aa  71.6  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00978119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0389  DNA translocase FtsK  28.12 
 
 
1068 aa  71.2  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0445802  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0303  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.44 
 
 
1326 aa  71.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1796  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.74 
 
 
1274 aa  71.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.988037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1033  FtsK/SpoIIIE family protein  27.35 
 
 
1309 aa  71.2  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0694  cell division FtsK/SpoIIIE  28.7 
 
 
1336 aa  71.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.809205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1831  cell division protein FtsK/SpoIIIE  29.74 
 
 
1274 aa  71.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.953109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11814  hypothetical protein  28 
 
 
1391 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284555  normal  0.623298 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0430  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.63 
 
 
1067 aa  70.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1577  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.17 
 
 
1501 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.887078  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5859  DNA segregation ATPase  27.18 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0407  cell division FtsK/SpoIIIE  28.42 
 
 
1316 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1210  cell division protein FtsK/SpoIIIE  30.89 
 
 
1320 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.978992  normal  0.356707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  31.93 
 
 
1236 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0638  FHA domain-containing protein  28.64 
 
 
1559 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.449825  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5659  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.45 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255861  normal  0.0102641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>