18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0901 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0901  hypothetical protein  100 
 
 		 937 aa  1909    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4624  hypothetical protein  24.1 
 
 		 856 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.21401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1112  NB-ARC domain-containing protein  27.2 
 
 		 447 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  26.52 
 
 		 941 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 1185 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 		 526 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  25.89 
 
 		 1500 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 785 aa  48.9  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 1146 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  24.8 
 
 		 838 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1212 aa  47  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.32 
 
 		 1309 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  24.29 
 
 		 1324 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 1128 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  24.26 
 
 		 910 aa  44.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  26.63 
 
 		 919 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  25.76 
 
 		 1014 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  24.92 
 
 		 1509 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>