14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4941 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4941  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 501 aa  999    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01060  putative hemin receptor  43.19 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.775355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1548  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.87 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.769333  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2912  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.48 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000266904  decreased coverage  0.000000000278928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5954  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.1 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000110154  normal  0.037452 
 
 
-
 
NC_002950  PG1626  hypothetical protein  28.71 
 
 		 554 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2312  hypothetical protein  26.68 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267242  hitchhiker  0.00619425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0219  hypothetical protein  25.38 
 
 		 517 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000733379  normal  0.0184964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2269  hypothetical protein  22.27 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.75 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  29.91 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>