14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4224 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4224  hypothetical protein  100 
 
 
1136 aa  2335    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4269  hypothetical protein  41.44 
 
 
1200 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0489651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.34 
 
 
676 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  26.13 
 
 
815 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  24.11 
 
 
727 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.98 
 
 
731 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.83 
 
 
732 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 
751 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.2 
 
 
732 aa  48.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.85 
 
 
734 aa  46.6  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.55 
 
 
708 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  26.15 
 
 
757 aa  46.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  21.55 
 
 
834 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.04 
 
 
723 aa  44.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>