More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3281 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2300  ATPase AAA-2 domain protein  45.29 
 
 
816 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3281  ATPase  100 
 
 
819 aa  1648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4874  ATPase AAA-2 domain protein  47.06 
 
 
823 aa  755    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4100  ATPase AAA-2 domain protein  45.29 
 
 
828 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3576  ATPase AAA-2 domain protein  48.46 
 
 
824 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1608  ATPase AAA-2 domain protein  38.55 
 
 
994 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000771621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  34.57 
 
 
864 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  34.45 
 
 
872 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  35.17 
 
 
872 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  37.5 
 
 
871 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  34.94 
 
 
862 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  34.73 
 
 
870 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  33.29 
 
 
825 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  33.73 
 
 
866 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0567  ATP-dependent chaperone ClpB  37.94 
 
 
862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  33.9 
 
 
825 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  37.61 
 
 
862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  37.19 
 
 
814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  34.15 
 
 
865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  33.93 
 
 
871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  35.75 
 
 
865 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1601  ATP-dependent chaperone ClpB  34.11 
 
 
864 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  34.84 
 
 
878 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  35.35 
 
 
873 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  37.84 
 
 
837 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  33.29 
 
 
868 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  33.02 
 
 
889 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  34.2 
 
 
864 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  33.49 
 
 
861 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  34.23 
 
 
866 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  38.81 
 
 
792 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  37.18 
 
 
876 aa  446  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  33.37 
 
 
826 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0672  ATPase AAA-2 domain protein  39.1 
 
 
982 aa  439  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  37.46 
 
 
861 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  36.01 
 
 
854 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  36.5 
 
 
812 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  34.15 
 
 
867 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  35.47 
 
 
875 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  36.12 
 
 
874 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3479  ATP-dependent chaperone ClpB  34.23 
 
 
880 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  38.5 
 
 
792 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  38.81 
 
 
855 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  33.18 
 
 
870 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  37.04 
 
 
815 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  36.39 
 
 
878 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  36.33 
 
 
862 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  35.31 
 
 
879 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  32.83 
 
 
864 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  32.05 
 
 
866 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  32.87 
 
 
876 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.27 
 
 
862 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  33.53 
 
 
867 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  33.88 
 
 
864 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  36.87 
 
 
818 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3955  ATPase  34.31 
 
 
864 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  32.19 
 
 
931 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  32.19 
 
 
874 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3128  ATPase  34.13 
 
 
859 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  31.68 
 
 
892 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  33.68 
 
 
858 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  36.74 
 
 
858 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  33.53 
 
 
864 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  35.07 
 
 
867 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  32.15 
 
 
872 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  35.27 
 
 
878 aa  439  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  33.22 
 
 
862 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  36.14 
 
 
863 aa  439  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  31.82 
 
 
866 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  34.94 
 
 
859 aa  438  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  32.04 
 
 
873 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  33.14 
 
 
893 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  32.79 
 
 
866 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  37.22 
 
 
816 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  35.32 
 
 
859 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  32.87 
 
 
859 aa  439  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  36.93 
 
 
864 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  33.05 
 
 
864 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0147  ATPase  32.7 
 
 
861 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.919618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  35.6 
 
 
879 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  38.4 
 
 
823 aa  439  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  33.1 
 
 
868 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  34.95 
 
 
868 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  36.26 
 
 
854 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  32.67 
 
 
868 aa  436  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  33.72 
 
 
883 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0085  ATP-dependent chaperone ClpB  35.22 
 
 
872 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.802904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  32.91 
 
 
857 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  36.77 
 
 
854 aa  433  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  35.03 
 
 
879 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3212  protein disaggregation chaperone  32.91 
 
 
857 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  34.42 
 
 
879 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  32.91 
 
 
857 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000133942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0665  ATPase  36.83 
 
 
854 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  35.94 
 
 
810 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  36.61 
 
 
789 aa  434  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  36.49 
 
 
862 aa  436  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  35.31 
 
 
874 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  33.77 
 
 
870 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  35.31 
 
 
874 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0502533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>