27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1641 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1641  PTS system, galactitol-specific IIB component, putative  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408521  hitchhiker  0.00362196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3261  PTS system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  92.55 
 
 		 94 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0236  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  35.79 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.48 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1729  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  38.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0436127  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1548  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  38.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1730  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  38.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1791  PTS system Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  38.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1727  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  38.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  35.48 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.94 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0122  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000835049  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4121  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.25 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.05 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  41.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2221  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.17 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3768  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  29.67 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4824  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  29.67 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2010  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  33.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000312148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4009  putative IIB component of PTS system  29.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09230  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  35.9 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3993  putative IIB component of PTS system  29.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4114  PTS system IIB component  29.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4064  putative PTS system transporter subunit IIB  29.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.801033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2663  sugar phosphotransferase component II B  32.26 
 
 		 89 aa  40  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.168546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0823  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  36.67 
 
 		 89 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>