16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0088 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0088    100 
 
 		 357 bp  708    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319553  hitchhiker  0.00000000288322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  97.84 
 
 		 1173 bp  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0057    96.3 
 
 		 1166 bp  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  85.39 
 
 		 1173 bp  254  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0075  transposase  84.62 
 
 		 411 bp  212  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4785    98.08 
 
 		 393 bp  190  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.509853 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  96.23 
 
 		 903 bp  89.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  100 
 
 		 798 bp  67.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  97.22 
 
 		 1389 bp  63.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>