16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0057 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0057    100 
 
 
1166 bp  2311    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  85 
 
 
1173 bp  934    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  85 
 
 
1173 bp  934    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  85 
 
 
1173 bp  934    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  85.08 
 
 
1173 bp  942    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  85.08 
 
 
1173 bp  942    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  85 
 
 
1173 bp  934    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  85 
 
 
1173 bp  934    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  84.91 
 
 
1173 bp  926    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  88.93 
 
 
903 bp  997    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  96.85 
 
 
1173 bp  2036    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0088    96.3 
 
 
357 bp  551  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319553  hitchhiker  0.00000000288322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4785    97.98 
 
 
393 bp  450  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.509853 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0075  transposase  90.45 
 
 
411 bp  196  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0141  putative transposase  83.56 
 
 
1116 bp  153  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  97.22 
 
 
1389 bp  63.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>