16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2654 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02397  predicted outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 172 aa  347  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02359  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.299722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1163  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.446008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2642  surface antigen family protein  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1172  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2654  surface antigen family protein  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.585362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3729  surface antigen family protein  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2789  surface antigen family protein  99.42 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2880  YfgH  99.04 
 
 		 109 aa  203  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1511  YfgH  53.85 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  36.78 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  29.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  29.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  29.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  29.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  29.89 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>