10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2880 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2880  YfgH  100 
 
 		 109 aa  214  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02397  predicted outer membrane lipoprotein  99.04 
 
 		 172 aa  203  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02359  hypothetical protein  99.04 
 
 		 172 aa  203  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.299722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1163  17 kDa surface antigen  99.04 
 
 		 171 aa  203  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.446008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2642  surface antigen family protein  99.04 
 
 		 171 aa  203  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1172  17 kDa surface antigen  99.04 
 
 		 171 aa  203  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2654  surface antigen family protein  99.04 
 
 		 171 aa  203  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.585362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3729  surface antigen family protein  99.04 
 
 		 171 aa  203  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2789  surface antigen family protein  98.08 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176508  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1511  YfgH  55.77 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>