20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1511 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1511  YfgH  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1172  17 kDa surface antigen  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02359  hypothetical protein  53.85 
 
 
172 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.299722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3729  surface antigen family protein  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2654  surface antigen family protein  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.585362  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2789  surface antigen family protein  53.25 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2642  surface antigen family protein  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1163  17 kDa surface antigen  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.446008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02397  predicted outer membrane lipoprotein  53.85 
 
 
172 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2880  YfgH  53.85 
 
 
109 aa  97.8  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  32.18 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  34.48 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>