14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1421 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1421  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2378  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2620  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1413  hypothetical protein  98.53 
 
 		 68 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2535  hypothetical protein  94.12 
 
 		 68 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02164  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02123  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  88.24 
 
 		 292 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  88.06 
 
 		 299 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  80.3 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  80.3 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  80.3 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  80.3 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  78.79 
 
 		 292 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>