14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02164 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02164  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02123  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2535  hypothetical protein  97.06 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1421  conserved hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2378  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2620  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  88.24 
 
 		 292 aa  120  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1413  hypothetical protein  89.71 
 
 		 68 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  86.57 
 
 		 299 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  75.76 
 
 		 292 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  75.76 
 
 		 292 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  75.76 
 
 		 292 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  75.76 
 
 		 292 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  74.24 
 
 		 292 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>