44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0812 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0812  tRNA-Asp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0019  tRNA-Asp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0753679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07691  tRNA-Asp  85.25 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0044  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0043  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.502025  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0025  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.140338  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0028  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0027  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0029  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0158  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0038  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000965548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0039  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000000917088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0040  tRNA-Asp  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000000989766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  88.64 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0848  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.473747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000252373  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000264705  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  82.43 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.241966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>