13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_R0007 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_R0007  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0029  tRNA-Sec  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0010  tRNA-Sec  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00270865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0061  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.802219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0058  tRNA-Sec  90.77 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.61906  normal  0.0910905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0035  tRNA-Sec  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0050  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00885539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-SeC(p)-1  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0020  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0028  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0015  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00457339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>