18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_R0020 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_R0020  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0044  tRNA-Sec  97.56 
 
 		 94 bp  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0047  tRNA-Sec  97.56 
 
 		 94 bp  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-SeC(p)-1  tRNA-Sec  96.25 
 
 		 94 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0050  tRNA-Sec  92.55 
 
 		 94 bp  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00885539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0059  tRNA-Sec  87.23 
 
 		 98 bp  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000143366  normal  0.164102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0050  tRNA-Sec  89.29 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000183308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0021  tRNA-Sec  96.77 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.926478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09640  tRNA-Sec  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.726499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0035  tRNA-Sec  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000422576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04240  tRNA-Sec  93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.203915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0010  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00270865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0061  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.802219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0007  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0012  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0023  tRNA-Sec  85.51 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0036  tRNA-Sec  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0670229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0029  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>