13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_R0058 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_R0058  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.61906  normal  0.0910905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0010  tRNA-Sec  96.92 
 
 		 90 bp  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00270865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0029  tRNA-Sec  90.77 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0007  tRNA-Sec  90.77 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0035  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0061  tRNA-Sec  85 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.802219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0028  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0015  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00457339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0050  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00885539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0047  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0044  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>