22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_R0035 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_R0035  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0029  tRNA-Sec  88.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0007  tRNA-Sec  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0010  tRNA-Sec  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00270865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0058  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.61906  normal  0.0910905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0061  tRNA-Sec  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.802219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4159  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>