31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_R0001 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 91 bp  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 91 bp  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 91 bp  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 95 bp  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  94.51 
 
 		 91 bp  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4159  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0001  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0001  tRNA-Sec  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0032  tRNA-Sec  85.94 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0005  tRNA-Sec  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  90.7 
 
 		 2076 bp  54  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0006  tRNA-Sec  81.32 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0079  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0005  tRNA-Sec  84.51 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0005  tRNA-Sec  81.32 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0078  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0005  tRNA-Sec  81.32 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0005  tRNA-Sec  81.32 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t002  tRNA-Sec  81.32 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0035  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>