22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_R0079 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_R0078  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0079  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0086  tRNA-Sec  91.3 
 
 		 96 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1677  hypothetical protein  86.96 
 
 		 537 bp  87.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2413  tRNA-Sec  86.96 
 
 		 96 bp  87.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4159  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  91.43 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  83.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>