14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_BR0086 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_BR0086  tRNA-Sec  100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622945 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0078  tRNA-Sec  91.3 
 
 		 92 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0079  tRNA-Sec  91.3 
 
 		 92 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1677  hypothetical protein  91.75 
 
 		 537 bp  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2413  tRNA-Sec  91.75 
 
 		 96 bp  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0074  tRNA-Sec  84.21 
 
 		 95 bp  69.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0002  tRNA-Sec  83.95 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0689793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2614  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0276643  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0176  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370505  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0453  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0341701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1473  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0135539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1386  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1123  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.416759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>