22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_R0002 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_R0002  tRNA-Sec  100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5525  tRNA-Sec  90.62 
 
 		 96 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63460  tRNA-Sec  90.22 
 
 		 92 bp  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0001  tRNA-Sec  88.06 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0086  tRNA-Sec  83.95 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.622945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0074  tRNA-Sec  84.93 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0001  tRNA-Sec  91.67 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  83.82 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2413  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1677  hypothetical protein  96.15 
 
 		 537 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  86.21 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>