13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0010 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0010  tRNA-Sec  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00270865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0029  tRNA-Sec  95.56 
 
 
90 bp  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0058  tRNA-Sec  96.92 
 
 
90 bp  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.61906  normal  0.0910905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0007  tRNA-Sec  90 
 
 
90 bp  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0061  tRNA-Sec  88.16 
 
 
90 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.802219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0035  tRNA-Sec  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196026  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0028  tRNA-Sec  100 
 
 
95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0050  tRNA-Sec  100 
 
 
94 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00885539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0015  tRNA-Sec  100 
 
 
95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 
95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00457339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 
95 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-SeC(p)-1  tRNA-Sec  100 
 
 
94 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0020  tRNA-Sec  100 
 
 
94 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>