52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3008 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1380  hypothetical protein  55.77 
 
 
112 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000150201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1569  hypothetical protein  53 
 
 
115 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.78 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.14 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.24 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.92 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.34 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  35.64 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0749  hypothetical protein  34.95 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.95 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.22 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.95 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.89 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.92 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.29 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.16 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.18 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.92 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  33.94 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  33.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  31.73 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  36.89 
 
 
230 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.25 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  24.27 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.7 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1433  hypothetical protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.3 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.48 
 
 
115 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1481  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.46 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  35.16 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  29.36 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.24 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.35 
 
 
114 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1686  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.71 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0395  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.25 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.39 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.99 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.83 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.34 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.17 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.89 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1982  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.61 
 
 
122 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.1 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  27 
 
 
248 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.96 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.85 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>