25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1990 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1990  protein kinase-like protein  100 
 
 		 747 aa  1454    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.533031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4334  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.109272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4274  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2436  hypothetical protein  30.84 
 
 		 326 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.933275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2431  hypothetical protein  30.49 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02030  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  40.65 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.586815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  20.99 
 
 		 315 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.43 
 
 		 611 aa  47.8  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 		 348 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  34.38 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 330 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 		 330 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 		 331 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 		 330 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 		 330 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 		 347 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  21.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  21.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 		 349 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 		 359 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  21.47 
 
 		 315 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  29.68 
 
 		 314 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.88 
 
 		 315 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>