15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_969 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_969  translation elongation factor-like protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000770952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1186  hypothetical protein  97.96 
 
 		 98 aa  199  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000564932  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0997  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  46.05 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  47.37 
 
 		 403 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  41.03 
 
 		 406 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  44.74 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  42.11 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  39.51 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  36.59 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  31.87 
 
 		 401 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  36.84 
 
 		 421 aa  50.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  30.85 
 
 		 416 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 462 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  33.33 
 
 		 414 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>