15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0997 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1186  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000564932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_969  translation elongation factor-like protein  100 
 
 
98 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000770952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0997  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  170  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  46.05 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  47.37 
 
 
403 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  41.03 
 
 
406 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  44.74 
 
 
403 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  42.11 
 
 
403 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  39.51 
 
 
411 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  36.59 
 
 
396 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  34.62 
 
 
401 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  36.84 
 
 
421 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  32.53 
 
 
416 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
462 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  33.33 
 
 
414 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>