35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_847 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_847  acetyltransferase  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  86.43 
 
 		 221 aa  410  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0974  puromycin N-acetyltransferase,-like protein  84.06 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  32.31 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  32.83 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  26.7 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  26.94 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  26.84 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  25.63 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  23.32 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 86 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  25.12 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  25.7 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  22.75 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  23.04 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  21.72 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  hitchhiker  0.00358603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  24.21 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  22.34 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2490  hypothetical protein  23.7 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000942107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  34.72 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5250  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.527352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  20.93 
 
 		 199 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>