13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2031 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2031  AAA ATPase  100 
 
 
1150 aa  2380    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000206232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1219  hypothetical protein  32.19 
 
 
773 aa  204  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000629207  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  27.36 
 
 
767 aa  189  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3532  hypothetical protein  28.19 
 
 
793 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3776  hypothetical protein  25.9 
 
 
745 aa  167  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.94629  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0485  hypothetical protein  24.76 
 
 
743 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212025  normal  0.046146 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6503  TIR protein  31.45 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.985723 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6594  hypothetical protein  24.15 
 
 
754 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0217  hypothetical protein  21.8 
 
 
738 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3802  hypothetical protein  20.12 
 
 
772 aa  63.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0133094  hitchhiker  0.00280043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2993  hypothetical protein  25.21 
 
 
244 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4976  hypothetical protein  20.88 
 
 
812 aa  48.5  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  28.43 
 
 
894 aa  45.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>