13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0485 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1514    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212025  normal  0.046146 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  34.83 
 
 		 767 aa  287  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1219  hypothetical protein  30.75 
 
 		 773 aa  250  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000629207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3776  hypothetical protein  31.65 
 
 		 745 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.94629  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3532  hypothetical protein  27.17 
 
 		 793 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2031  AAA ATPase  24.76 
 
 		 1150 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000206232  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6503  TIR protein  27.92 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.985723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0217  hypothetical protein  23.88 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4976  hypothetical protein  22.83 
 
 		 812 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3802  hypothetical protein  22.94 
 
 		 772 aa  63.9  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0133094  hitchhiker  0.00280043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6594  hypothetical protein  22.42 
 
 		 754 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  40 
 
 		 743 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2993  hypothetical protein  23.77 
 
 		 244 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>