14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2993 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2993  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6594  hypothetical protein  76.72 
 
 
754 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0217  hypothetical protein  52.42 
 
 
738 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3802  hypothetical protein  38.16 
 
 
772 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0133094  hitchhiker  0.00280043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4976  hypothetical protein  38.46 
 
 
812 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0954  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1219  hypothetical protein  23.42 
 
 
773 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000629207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2031  AAA ATPase  25.21 
 
 
1150 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000206232  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0118  hypothetical protein  29.03 
 
 
337 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3776  hypothetical protein  24.12 
 
 
745 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.94629  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3532  hypothetical protein  23.42 
 
 
793 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0135  hypothetical protein  27.42 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.385897  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  20.27 
 
 
767 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0485  hypothetical protein  23.77 
 
 
743 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212025  normal  0.046146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>