19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1560 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  64.89 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  36.94 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  57.74 
 
 		 196 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  38.08 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  47.62 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  48.81 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  45.9 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  43.71 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  41.88 
 
 		 426 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  26.14 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  26.14 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  26.15 
 
 		 684 aa  75.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  30.61 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 652 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1831  hypothetical protein  31.4 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504121 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  25.25 
 
 		 642 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  26.51 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  25.48 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>