15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2901 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  45.76 
 
 
412 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  47.46 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  38.27 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  27.07 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  34.88 
 
 
416 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  31.4 
 
 
426 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  23.91 
 
 
426 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  32.39 
 
 
456 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  32.39 
 
 
456 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  34.33 
 
 
684 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  40.35 
 
 
341 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  32.63 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1197  hypothetical protein  34.83 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00107487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  34.25 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.39656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>