14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2071 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  41.7 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  28.28 
 
 		 472 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  28.28 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  28.87 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  29.52 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  29.63 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  28.4 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  25.44 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  26.8 
 
 		 684 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  28.4 
 
 		 426 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  25.93 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  26.51 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.39656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>