21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0391 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  100 
 
 
196 aa  391  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  58.03 
 
 
341 aa  198  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  58.19 
 
 
303 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  52.38 
 
 
409 aa  167  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  47.95 
 
 
412 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  49.12 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  46.93 
 
 
287 aa  161  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  50.87 
 
 
416 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  44.92 
 
 
426 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  47.88 
 
 
426 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  25 
 
 
456 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  25 
 
 
456 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  23.21 
 
 
684 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  29.31 
 
 
472 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  27.55 
 
 
293 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  32.63 
 
 
274 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 
652 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  28.4 
 
 
296 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  27.71 
 
 
642 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1769  hypothetical protein  27.27 
 
 
581 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.109783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1969  hypothetical protein  27.27 
 
 
581 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194533  normal  0.770466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>