46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1310 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 85 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1565  iron-sulfur cluster-binding protein  63.38 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000782639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2731  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.56 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.535435  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_002936  DET1164  iron-sulfur cluster-binding protein  34.09 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.624283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0563  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.978670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.14 
 
 		 282 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  33.33 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07910  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.33 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00191452  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 		 334 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0264  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  38.6 
 
 		 335 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0095  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 654 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0986  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.27 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.84 
 
 		 335 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  35.29 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.38 
 
 		 748 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 557 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 1116 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 		 793 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  31.58 
 
 		 747 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000475008  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 652 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  34.55 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.33 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 652 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.71 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 519 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2260  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.62 
 
 		 438 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00125851  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  38.75 
 
 		 478 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.71 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000481953 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 367 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.51 
 
 		 503 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2321  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.1 
 
 		 81 aa  40  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  33.9 
 
 		 376 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24680  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain G-like protein  29.27 
 
 		 251 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 508 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>